140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0405 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  100 
 
 		 324 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  99.38 
 
 		 324 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  99.38 
 
 		 324 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  93.83 
 
 		 323 aa  614  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  93.21 
 
 		 323 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  80.71 
 
 		 322 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2805  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 352 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2712  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 340 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  81.03 
 
 		 322 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  80.71 
 
 		 322 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  80.71 
 
 		 322 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1914  HPr kinase/phosphorylase  70.19 
 
 		 328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1619  HPr kinase/phosphorylase  70.5 
 
 		 328 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.984751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  59.37 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  58.73 
 
 		 316 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0752  HPr kinase/phosphorylase  59.42 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0947007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0405  HPr kinase/phosphorylase  58.28 
 
 		 319 aa  355  6.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  58.18 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  56.87 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  58.12 
 
 		 318 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  57.83 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  57.83 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0473  HPr kinase/phosphorylase  56.88 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0224  HPr kinase/phosphorylase  55.87 
 
 		 318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  56.86 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  53.42 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0082  HPr kinase/phosphorylase  46.47 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  45.66 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  44.48 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  43 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  42.35 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  42.35 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0723  HPr kinase  42.21 
 
 		 315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  41.69 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  36.31 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0373  HPr kinase  42.44 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.254588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0151  HPr kinase/phosphorylase  34.92 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.131882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0146  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0153  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.784698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0164  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  37.73 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  35.25 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  34.6 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  34.92 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  34.92 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  34.92 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  34.6 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  34.6 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  34.58 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  34.81 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  35 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  35 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  33.87 
 
 		 319 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  33 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  31.56 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  33.85 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  32.48 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.55 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  34.55 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  33.21 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  34.62 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  34.23 
 
 		 311 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1885  HPr kinase/phosphorylase  35.2 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  32.58 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  36.29 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1285  HPr kinase/phosphorylase  35.14 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.758729  hitchhiker  0.00000064658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  34.63 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  34.63 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2969  HPr kinase/phosphorylase  33.23 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.475153  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  33.59 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  32.96 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  32.85 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  33.09 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  32.24 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  33.46 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  29.94 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  31.46 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3388  HPr kinase/phosphorylase  32.79 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  31.44 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  32.03 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0871  HPr kinase/phosphorylase  32.47 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  34.59 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  32.39 
 
 		 330 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>