165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0210 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0210  HPr kinase/phosphorylase  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2563  HPr kinase  48.15 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.83 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  47.1 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2439  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.6 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.35684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  44.19 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0400  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  50 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0476517  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2905  HPr kinase  54.55 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0465  HPr kinase  45.38 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2847  HPr kinase  43.24 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  47.73 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  46.15 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0441  HPr kinase  39.82 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  33.56 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  38.71 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7369  HPr kinase  41.9 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0113  HPr kinase  43.38 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  34.93 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0253  HPr kinase  42.42 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0460144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  40.79 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  40.79 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1398  HPr kinase  43.81 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  33.56 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1236  HPr kinase  42.15 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  44.74 
 
 		 308 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1177  HPr kinase  43.16 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  42.39 
 
 		 320 aa  60.5  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0346  hypothetical protein  35.59 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.26045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3449  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.56 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0595  HPr kinase  42.5 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0343578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  38.16 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  50 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  45.45 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0447  HPr kinase  38.32 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  43.59 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  41.33 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  41.33 
 
 		 310 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2739  HPr kinase  38.32 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.192127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0359  HPr kinase  36.54 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  40.22 
 
 		 318 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  41.33 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0144  HPr kinase/phosphorylase  33.07 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.840136 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  42.67 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  45.33 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0747  HPr kinase  37.5 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.659883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  41.33 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4628  HPr kinase  34.92 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.256939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  42.67 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0638  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 		 311 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  37.84 
 
 		 339 aa  53.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2164  HPr kinase/phosphorylase  38.67 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  31.96 
 
 		 346 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0412  HPr kinase  41.1 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  32.41 
 
 		 311 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  40 
 
 		 330 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0976  HPr kinase/phosphorylase  38.67 
 
 		 319 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3250  HPr kinase  32.89 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5435  HPr kinase  43.01 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0668  HPr kinase/phosphorylase  38.67 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  36.25 
 
 		 339 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0754  HPr kinase/phosphorylase  38.67 
 
 		 316 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.46702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0602  HPr kinase/phosphorylase  32.1 
 
 		 318 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3573  HPr kinase  34.92 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3925  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 318 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3273  HPr kinase/phosphorylase  33.33 
 
 		 318 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  36.36 
 
 		 305 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1002  HPr kinase/phosphorylase  32.1 
 
 		 318 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0951  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 		 316 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0777  HPr kinase/phosphorylase  31.91 
 
 		 313 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4611  HPr kinase/phosphorylase  32.1 
 
 		 316 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0563  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.8 
 
 		 319 aa  50.4  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0046  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  36.71 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0373  HPr kinase  39.24 
 
 		 343 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.254588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02224  HPr kinase/phosphorylase  37.33 
 
 		 316 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.375894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3967  HPr kinase  38.1 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0705  HPr kinase/phosphorylase  37.33 
 
 		 315 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.447864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  29.29 
 
 		 308 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2630  HPr kinase  36.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3022  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  25 
 
 		 308 aa  49.3  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0597  Serine kinase of the HPr protein, regulates carbohydrate metabolism  37.66 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4556  HPr kinase/phosphorylase  32.1 
 
 		 318 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3792  HPr kinase/phosphorylase  32.47 
 
 		 316 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2617  HPr kinase  34.21 
 
 		 605 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00751304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0757  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.825604  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1208  HPr kinase/phosphorylase  36.84 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>