48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2661 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  34.23 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  33.45 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  30.63 
 
 		 301 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  28.19 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  30.83 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.62 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.38 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.11 
 
 		 340 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.81 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.5 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  29.62 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  30 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  26.15 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  27.39 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  27.12 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  25 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  26.94 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  25.64 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  31.07 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.88 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  28.37 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  26.32 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  33.01 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  25 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  49.12 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  43.1 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  23.39 
 
 		 341 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  40.48 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.68 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  21.37 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  44.93 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  35.82 
 
 		 339 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0856  hypothetical protein  25.13 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  34.88 
 
 		 398 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  36.21 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  36.84 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.12 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0369  HPr kinase  38.46 
 
 		 153 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  51.16 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  36.92 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  31.82 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  30.16 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2373  HPr kinase  26.71 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  33.96 
 
 		 203 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  35 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  34.85 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>