More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2925 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  825    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  62.07 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  59.41 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  58.16 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  30 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.02 
 
 		 1833 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  28.01 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  27.75 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  27.65 
 
 		 411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 445 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 439 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 		 410 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 439 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.45 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.36 
 
 		 1816 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 434 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 432 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 474 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.46 
 
 		 1876 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.89 
 
 		 1829 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.45 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  25.59 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 449 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  27.2 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 433 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.6 
 
 		 1806 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.46 
 
 		 2720 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  28.57 
 
 		 1769 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 		 414 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.77 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  32.79 
 
 		 134 aa  93.6  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.26 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  23.87 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  25.91 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.03 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  21.84 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.03 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.51 
 
 		 417 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.74 
 
 		 1839 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.74 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.79 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  22.34 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 499 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.07 
 
 		 1864 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  29.75 
 
 		 495 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 427 aa  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.57 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.71 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 433 aa  86.7  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 406 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  20.51 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.01 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.62 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  19.79 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.47 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>