35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1524 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1524  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 176 aa  354  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.274327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0222  hypothetical protein  49.08 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01790  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  48.12 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0615526  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0221  hypothetical protein  49.33 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01780  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.36 
 
 		 208 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825093  normal  0.558604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0802  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.62 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2284  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.61 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1021  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.33 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0577  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  46.67 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.659586  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3363  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.13 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1148  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2478  putative nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03940  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  44.24 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4306  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.33 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3893  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.45 
 
 		 213 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.38483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0760  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154684  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0694  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.67 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744555  normal  0.147184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1903  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.46 
 
 		 160 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0637  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  43.59 
 
 		 183 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0745  hypothetical protein  40.48 
 
 		 161 aa  104  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2970  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40 
 
 		 204 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5430  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.76 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0545141  hitchhiker  0.0071685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3273  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0797812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3110  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.84 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1474  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  40.14 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1013  hypothetical protein  37.25 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0039  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.34 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  0.0188218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1127  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase family protein  31.49 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.943646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3545  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.99 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3378  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.67 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.778216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2788  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  30.97 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  28.44 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  25.69 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.46 
 
 		 142 aa  42  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  32.76 
 
 		 144 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>