39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1415 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  69.06 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0136  hypothetical protein  48.55 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.595225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  47.76 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0103  hypothetical protein  48.92 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0252729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0266  hypothetical protein  39.23 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  38.13 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3867  nucleotide binding protein, PINc  38.64 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2307  PilT protein domain protein  36.3 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000833528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00608  hypothetical protein  35.11 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2883  hypothetical protein  34.06 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0993  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1022  hypothetical protein  30.08 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0618  hypothetical protein  45.05 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2742  hypothetical protein  35.51 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0540  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  38.05 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  27.74 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  56.82 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  31.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4198  hypothetical protein  32.98 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.340212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1646  nucleic acid binding protein  26.21 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4904  Nucleotide binding protein PINc  29.66 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202303  normal  0.0310303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  48.89 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  44.68 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  28.87 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5667  hypothetical protein  30.71 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  52.27 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  35.4 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1354  nucleic acid binding protein  30.83 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  33.88 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  26.21 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  52.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  52.27 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  54.76 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  29.91 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  27.82 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>