44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1247 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  219  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  54.21 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  54.21 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  54.21 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  48.11 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  53.09 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1868  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  31.19 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  52.78 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 63 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  38.6 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  29.73 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  38.24 
 
 		 111 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 73 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>