More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0431 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0431  dimethyladenosine transferase  100 
 
 		 288 aa  564  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3343  dimethyladenosine transferase  60.74 
 
 		 281 aa  311  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2833  dimethyladenosine transferase  61.25 
 
 		 288 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137486  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1809  dimethyladenosine transferase  58.03 
 
 		 305 aa  308  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.957431  normal  0.3003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2226  dimethyladenosine transferase  63.67 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.587183 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1206  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547269  hitchhiker  0.00130975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3924  dimethyladenosine transferase  59.51 
 
 		 291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1063  dimethyladenosine transferase  57.88 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0156992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1549  dimethyladenosine transferase  57.04 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0654  dimethyladenosine transferase  59.27 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.712331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1762  dimethyladenosine transferase  58.03 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2905  dimethyladenosine transferase  56.67 
 
 		 278 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1537  dimethyladenosine transferase  57.56 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.22522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0760  dimethyladenosine transferase  58.03 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676822  normal  0.117293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3826  dimethyladenosine transferase  58.82 
 
 		 286 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3639  dimethyladenosine transferase  58.8 
 
 		 296 aa  295  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.227832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2971  dimethyladenosine transferase  60.36 
 
 		 287 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.325884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2345  dimethyladenosine transferase  57.35 
 
 		 287 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3476  dimethyladenosine transferase  61.25 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1116  dimethyladenosine transferase  56.25 
 
 		 278 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0735586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2308  dimethyladenosine transferase  60.29 
 
 		 286 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0944  dimethyladenosine transferase  56.57 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5840  dimethyladenosine transferase  59.57 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2475  dimethyladenosine transferase  61.62 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0552  dimethyladenosine transferase  61.87 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0897  dimethyladenosine transferase  57.61 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00367265  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1185  dimethyladenosine transferase  55.27 
 
 		 280 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230549  normal  0.468097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5102  dimethyladenosine transferase  58.91 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_004310  BR0682  dimethyladenosine transferase  57.51 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0674  dimethyladenosine transferase  57.51 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1682  dimethyladenosine transferase  56.99 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3931  dimethyladenosine transferase  57.39 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2525  dimethyladenosine transferase  54.8 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2606  dimethyladenosine transferase  56.93 
 
 		 278 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3042  dimethyladenosine transferase  54.14 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733787  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0503  dimethyladenosine transferase  53.09 
 
 		 276 aa  262  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2624  dimethyladenosine transferase  56.55 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1221  dimethyladenosine transferase  51.79 
 
 		 289 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.675859  normal  0.381466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0408  dimethyladenosine transferase  51.66 
 
 		 276 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0413158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0886  dimethyladenosine transferase  53.53 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.299134  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1478  dimethyladenosine transferase  51.66 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.736244 
 
 
-
 
NC_002978  WD0090  dimethyladenosine transferase  41.09 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0802861  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0648  dimethyladenosine transferase  36.53 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0392  dimethyladenosine transferase  37.94 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00834232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0736  dimethyladenosine transferase  47.43 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07730  dimethyladenosine transferase  46.46 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0104234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0432  dimethyladenosine transferase  43.53 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46830  dimethyladenosine transferase  44.57 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0551  dimethyladenosine transferase  43.08 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4801  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0862  dimethyladenosine transferase  41.7 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.309143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0435  dimethyladenosine transferase  43.48 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0401  dimethyladenosine transferase  43.48 
 
 		 267 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2995  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 		 256 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1721  16S rRNA dimethylase  44.83 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1980  dimethyladenosine transferase  45.45 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0964  dimethyladenosine transferase  40.93 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.337956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4013  dimethyladenosine transferase  45.1 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2855  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 		 256 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1014  dimethyladenosine transferase  40.93 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0323171  hitchhiker  0.000547982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4627  dimethyladenosine transferase  42.69 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0604  dimethyladenosine transferase  43.36 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000235675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03414  dimethyladenosine transferase  43.36 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5135  dimethyladenosine transferase  42.97 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0737  dimethyladenosine transferase  41 
 
 		 268 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1277  dimethyladenosine transferase  40 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.772647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2325  dimethyladenosine transferase  43.28 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317998  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0668  dimethyladenosine transferase  44.53 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0518  dimethyladenosine transferase  41.38 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1051  dimethyladenosine transferase  41.6 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402858  normal  0.593327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3421  dimethyladenosine transferase  40.61 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0879  dimethyladenosine transferase  38.93 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3635  dimethyladenosine transferase  42.86 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3656  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0224155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0602  dimethyladenosine transferase  41.13 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1457  dimethyladenosine transferase  42.32 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2819  dimethyladenosine transferase  41.29 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.908196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0905  dimethyladenosine transferase  40.23 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.983231  normal  0.2455 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0362  dimethyladenosine transferase  38.25 
 
 		 262 aa  172  7.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21720  dimethyladenosine transferase  35.96 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.700032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0267  dimethyladenosine transferase  43.19 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0131  dimethyladenosine transferase  44.32 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.684706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0724  dimethyladenosine transferase  40.75 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.682335  normal  0.907502 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3115  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0772  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0349133  normal  0.113375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3507  dimethyladenosine transferase  39.46 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3832  dimethyladenosine transferase  42.08 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3444  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1288  dimethyladenosine transferase  39.67 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1352  dimethyladenosine transferase  39.67 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3573  dimethyladenosine transferase  40.15 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1047  dimethyladenosine transferase  40.68 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.503056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3209  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.601511  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1559  dimethyladenosine transferase  39.34 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3639  dimethyladenosine transferase  39.85 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2718  dimethyladenosine transferase  42.01 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0989  dimethyladenosine transferase  39.08 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0045  dimethyladenosine transferase  39.66 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0045  dimethyladenosine transferase  39.92 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0201107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0055  dimethyladenosine transferase  39.54 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00458871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>