207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0147 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  100 
 
 		 550 aa  1050    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  48.5 
 
 		 550 aa  428  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  44.27 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  45.92 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 478 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 471 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 471 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 465 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 472 aa  353  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  44.36 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 472 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 475 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  44.05 
 
 		 515 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  43.78 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  44.05 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  42.5 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  43.66 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  43.88 
 
 		 519 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  42.95 
 
 		 515 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  57.21 
 
 		 466 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  55.83 
 
 		 466 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  49.08 
 
 		 630 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 459 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  57.71 
 
 		 478 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  52.45 
 
 		 415 aa  208  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  45.76 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  50.49 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  49.54 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  56.99 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  55.38 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  55.03 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  29.9 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  54.19 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  52.36 
 
 		 598 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  31.72 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  46.89 
 
 		 594 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  46.89 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 547 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  47.42 
 
 		 1565 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  47.42 
 
 		 1565 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  46.31 
 
 		 439 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 450 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 482 aa  163  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  25.8 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 478 aa  160  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  31.78 
 
 		 509 aa  158  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 454 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  39.22 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  42.99 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 461 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  30.1 
 
 		 509 aa  144  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  43.5 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3019  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.649834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  39.41 
 
 		 495 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  40.19 
 
 		 419 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  38.6 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  40.5 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.81 
 
 		 428 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  38.71 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  39.71 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  32.89 
 
 		 447 aa  125  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  42.19 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  38.25 
 
 		 426 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  38.39 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  34.75 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  38.5 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  38.65 
 
 		 491 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  38 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>