142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1347 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1347  Male sterility domain  100 
 
 		 367 aa  756    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.416798  normal  0.0755507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1411  Male sterility domain protein  94.82 
 
 		 367 aa  725    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1165  Male sterility domain  83.65 
 
 		 367 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1462  putative signal peptide protein  81.74 
 
 		 367 aa  630  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.653103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3771  hypothetical protein  45.16 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44311  hypothetical protein  44.62 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3227  Male sterility domain protein  36.76 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0566277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3212  hypothetical protein  36.56 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0204352 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0098  hemolysin F  37.43 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0392616  hitchhiker  0.000000811123 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3085  hypothetical protein  37 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2515  hypothetical protein  36.73 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2419  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1737  hypothetical protein  36.07 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0887086  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.34 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1021  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.79 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0936  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.79 
 
 		 395 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1142  hypothetical protein  35.52 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0098  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.52 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.992501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1515  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.52 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4125  hypothetical protein  32.63 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4137  Male sterility-like  32.46 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4229  hypothetical protein  32.46 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3288  hypothetical protein  32.46 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.120126 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3651  hypothetical protein  32.19 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4376  hypothetical protein  31.02 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  29.49 
 
 		 1498 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  30.15 
 
 		 1436 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23800  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  25.75 
 
 		 937 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  28.95 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.32 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3013  hypothetical protein  27.94 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0103839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  27.09 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4147  hypothetical protein  27.98 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.84 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.25 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05610  aminoadipate reductase large subunit (Eurofung)  27.92 
 
 		 1421 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0476531 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  29.01 
 
 		 1506 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  29.8 
 
 		 1485 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.66 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  27.69 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4933  Male sterility domain protein  28.27 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349129  normal  0.407936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  29.83 
 
 		 701 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 		 650 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05348  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0521089  normal  0.0191103 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 506 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  28.29 
 
 		 1500 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3148  Male sterility domain protein  28.36 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18005  normal  0.119143 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.68 
 
 		 1270 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.94 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0002  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.26 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  26 
 
 		 2199 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 330 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  25.38 
 
 		 1454 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.79 
 
 		 1449 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  25 
 
 		 505 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  25.1 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 		 321 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.39 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  27.96 
 
 		 2113 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3702  thioester reductase domain protein  26.98 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3755  thioester reductase domain protein  26.98 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.801599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  22.27 
 
 		 661 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  29.14 
 
 		 4122 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  27.63 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  27.89 
 
 		 1413 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  29.14 
 
 		 4580 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  29.14 
 
 		 4123 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  29.45 
 
 		 4098 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  29.45 
 
 		 4101 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2551  hypothetical protein  25.56 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0234245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  29.14 
 
 		 4157 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  28.46 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  29.3 
 
 		 4048 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.01 
 
 		 320 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  24.91 
 
 		 1067 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  27.02 
 
 		 671 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.32 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.04 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  23.97 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  25.39 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4292  amino acid adenylation domain-containing protein  26.77 
 
 		 1188 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375384  normal  0.670751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>