31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4017 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2027  AsmA  56.33 
 
 		 1273 aa  1192    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  47.03 
 
 		 1239 aa  911    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  57.39 
 
 		 1308 aa  1238    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  45.66 
 
 		 1275 aa  982    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  46.7 
 
 		 1258 aa  909    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  100 
 
 		 1274 aa  2412    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  28.86 
 
 		 1331 aa  241  6.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  25 
 
 		 1246 aa  183  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1230 aa  176  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1234 aa  163  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1238 aa  159  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1247 aa  147  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  24.03 
 
 		 1273 aa  145  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  23.54 
 
 		 1278 aa  144  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1247 aa  140  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  26.04 
 
 		 1186 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.94 
 
 		 1146 aa  85.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1146 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1174 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25 
 
 		 1077 aa  66.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1179 aa  65.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  28 
 
 		 1210 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1175 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  40 
 
 		 1175 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.95 
 
 		 632 aa  49.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  33.02 
 
 		 999 aa  48.9  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  27.69 
 
 		 630 aa  48.9  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  27.91 
 
 		 630 aa  49.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.21 
 
 		 812 aa  48.9  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  31.58 
 
 		 699 aa  46.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  22.84 
 
 		 423 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>