More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3128 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.98 
 
 		 969 aa  1057    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.5 
 
 		 971 aa  1018    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.33 
 
 		 931 aa  744    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  100 
 
 		 975 aa  1918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.1 
 
 		 930 aa  763    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.9 
 
 		 983 aa  1022    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.36 
 
 		 938 aa  741    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  63.77 
 
 		 972 aa  1146    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  59.6 
 
 		 972 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  64.11 
 
 		 967 aa  1189    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.32 
 
 		 984 aa  1105    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  64.48 
 
 		 997 aa  1211    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.29 
 
 		 972 aa  1021    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  63.77 
 
 		 971 aa  1137    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.25 
 
 		 941 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.35 
 
 		 981 aa  1102    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.6 
 
 		 931 aa  743    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.66 
 
 		 943 aa  774    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  66.94 
 
 		 980 aa  1202    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.5 
 
 		 971 aa  1017    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.15 
 
 		 966 aa  1057    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.29 
 
 		 964 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.01 
 
 		 984 aa  1101    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.19 
 
 		 964 aa  1018    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.77 
 
 		 962 aa  988    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.15 
 
 		 947 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.5 
 
 		 975 aa  1027    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.46 
 
 		 1024 aa  996    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.57 
 
 		 953 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.83 
 
 		 961 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.62 
 
 		 952 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.73 
 
 		 943 aa  793    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.53 
 
 		 958 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.28 
 
 		 966 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.06 
 
 		 975 aa  1076    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.69 
 
 		 971 aa  1008    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.76 
 
 		 958 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.89 
 
 		 932 aa  680    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  68.61 
 
 		 978 aa  1178    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  63.77 
 
 		 970 aa  1144    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.75 
 
 		 953 aa  668    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.09 
 
 		 973 aa  1073    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.75 
 
 		 979 aa  1102    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  53.94 
 
 		 931 aa  747    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.7 
 
 		 969 aa  709    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.61 
 
 		 971 aa  1024    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.62 
 
 		 992 aa  1116    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.3 
 
 		 933 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.86 
 
 		 932 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52 
 
 		 933 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.78 
 
 		 930 aa  798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  55.19 
 
 		 959 aa  961    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.82 
 
 		 931 aa  764    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.39 
 
 		 933 aa  770    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.83 
 
 		 979 aa  1103    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  62 
 
 		 1006 aa  1072    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.13 
 
 		 946 aa  621  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.48 
 
 		 949 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.31 
 
 		 949 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.31 
 
 		 949 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.58 
 
 		 799 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.65 
 
 		 790 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  38.95 
 
 		 792 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 		 788 aa  445  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  34.59 
 
 		 889 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.53 
 
 		 800 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.68 
 
 		 800 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.68 
 
 		 800 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.22 
 
 		 1003 aa  422  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.49 
 
 		 769 aa  419  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.32 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.13 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.13 
 
 		 801 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  38.42 
 
 		 790 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.22 
 
 		 966 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.41 
 
 		 767 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.22 
 
 		 966 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.73 
 
 		 950 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.22 
 
 		 966 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.25 
 
 		 767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.28 
 
 		 772 aa  403  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  36.94 
 
 		 980 aa  403  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.95 
 
 		 1004 aa  399  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.36 
 
 		 968 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.85 
 
 		 1014 aa  399  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.04 
 
 		 969 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.55 
 
 		 766 aa  392  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  34.3 
 
 		 891 aa  389  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.55 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  38.01 
 
 		 906 aa  389  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.5 
 
 		 767 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.79 
 
 		 999 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.06 
 
 		 956 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.86 
 
 		 768 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.63 
 
 		 785 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.86 
 
 		 768 aa  386  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.14 
 
 		 786 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.05 
 
 		 929 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.57 
 
 		 770 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.69 
 
 		 791 aa  380  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>