More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1293 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
154 aa  314  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  91.61 
 
 
163 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  89.04 
 
 
153 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  83.33 
 
 
148 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  75.69 
 
 
153 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  75 
 
 
153 aa  233  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  71.23 
 
 
149 aa  221  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.1 
 
 
191 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  69.8 
 
 
204 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  65.52 
 
 
169 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  53.96 
 
 
143 aa  146  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  55.71 
 
 
153 aa  146  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  58.78 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  55.47 
 
 
150 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  54.89 
 
 
135 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  53.79 
 
 
132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  57.03 
 
 
144 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  50 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  52.99 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.77 
 
 
151 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  49.64 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.07 
 
 
151 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.99 
 
 
158 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1214  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
156 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  45.38 
 
 
144 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.11 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  50.41 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  46.51 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.51 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.76 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.54 
 
 
135 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.88 
 
 
136 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.97 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  46.28 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.06 
 
 
131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  42.86 
 
 
134 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.56 
 
 
145 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.45 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
143 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.06 
 
 
134 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  42.86 
 
 
160 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1644  hypothetical protein  39.58 
 
 
149 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.996621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.06 
 
 
134 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
146 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.63 
 
 
148 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
166 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.11 
 
 
136 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.36 
 
 
149 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.09 
 
 
159 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.15 
 
 
141 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
134 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.98 
 
 
161 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.79 
 
 
133 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  41.32 
 
 
164 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.79 
 
 
133 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.79 
 
 
133 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  40.65 
 
 
161 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  40.65 
 
 
161 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  40.65 
 
 
161 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  40.65 
 
 
161 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  41.32 
 
 
164 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.13 
 
 
134 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  40.5 
 
 
164 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.19 
 
 
157 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.98 
 
 
161 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.24 
 
 
124 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.75 
 
 
133 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.75 
 
 
133 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.22 
 
 
132 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.8 
 
 
139 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.3 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  41.98 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.8 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.34 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  47.69 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.52 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.03 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.32 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.32 
 
 
161 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.26 
 
 
134 aa  97.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.67 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.19 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.5 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1064  hypothetical protein  41.67 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.58 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.15 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.64 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  41.67 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.76 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.91 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.16 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.32 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.62 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2137  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.89 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.59 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>