More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1042 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  70.09 
 
 		 818 aa  1124    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  47.03 
 
 		 806 aa  639    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  68.83 
 
 		 814 aa  1104    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  68.83 
 
 		 814 aa  1104    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  89.67 
 
 		 813 aa  1467    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  64.08 
 
 		 817 aa  1010    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2696  copper-translocating P-type ATPase  66.12 
 
 		 792 aa  1040    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.276003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3666  copper-translocating P-type ATPase  51.04 
 
 		 845 aa  764    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  66.5 
 
 		 823 aa  1064    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4364  copper-translocating P-type ATPase  88.19 
 
 		 811 aa  1447    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.750997  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  45.36 
 
 		 857 aa  648    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  53.68 
 
 		 768 aa  776    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1743  heavy metal translocating P-type ATPase  53.29 
 
 		 775 aa  741    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.489766  decreased coverage  0.00448876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 813 aa  1643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  52.11 
 
 		 818 aa  751    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0838217  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5313  copper-translocating P-type ATPase  54.57 
 
 		 795 aa  796    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.620833 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5696  copper-translocating P-type ATPase  54.44 
 
 		 795 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.698051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  53.68 
 
 		 768 aa  776    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3678  copper-translocating P-type ATPase  54.32 
 
 		 796 aa  782    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0521178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5853  heavy metal translocating P-type ATPase  53.71 
 
 		 767 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  68.32 
 
 		 889 aa  1001    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  46.13 
 
 		 793 aa  632  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.34 
 
 		 954 aa  608  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40.93 
 
 		 889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  41.4 
 
 		 889 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  41.32 
 
 		 942 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 758 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.83 
 
 		 821 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 836 aa  562  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.61 
 
 		 797 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 		 814 aa  559  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 753 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  42.14 
 
 		 849 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 		 894 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 		 818 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  40.87 
 
 		 752 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1535  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 		 643 aa  552  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  38.86 
 
 		 857 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  41.01 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 837 aa  549  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 		 817 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  42.74 
 
 		 680 aa  542  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  41.2 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 872 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 827 aa  542  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  40.15 
 
 		 815 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.14 
 
 		 805 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  44.96 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  44.96 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2779  copper-translocating P-type ATPase  43.51 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2404  copper-translocating P-type ATPase  43.51 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2439  copper-translocating P-type ATPase  43.57 
 
 		 674 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0167  copper-translocating P-type ATPase  43 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2066  copper-translocating P-type ATPase  43.57 
 
 		 674 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.694295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 		 806 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  38.94 
 
 		 805 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0818  copper P-type ATPase  42.44 
 
 		 829 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  46.07 
 
 		 795 aa  531  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 803 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  39.57 
 
 		 851 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 838 aa  529  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 821 aa  531  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  38.9 
 
 		 806 aa  528  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 750 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  38.82 
 
 		 805 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  38.9 
 
 		 806 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6888  copper-translocating P-type ATPase  41.85 
 
 		 740 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.7 
 
 		 805 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 747 aa  523  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  44.59 
 
 		 760 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 		 814 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1876  cation transport ATPase  44.1 
 
 		 644 aa  525  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000004202 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  38.84 
 
 		 742 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  45.13 
 
 		 767 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  38.17 
 
 		 826 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 		 786 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 828 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.73 
 
 		 797 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 798 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  39.54 
 
 		 836 aa  519  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 798 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0431  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000145431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 		 810 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1587  copper/silver efflux P-type ATPase  43.65 
 
 		 814 aa  513  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.602341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 		 814 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  41.53 
 
 		 786 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  43.37 
 
 		 822 aa  515  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  45.32 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  44.75 
 
 		 804 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  45.97 
 
 		 823 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  40.53 
 
 		 831 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  39.26 
 
 		 758 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  39 
 
 		 867 aa  514  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6642  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 		 755 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.622167 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.29 
 
 		 802 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  47.89 
 
 		 804 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>