More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3092 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  88.55 
 
 		 131 aa  243  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  55.37 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  55.65 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  55.65 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  46.22 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  42.62 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 154 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 154 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  42.06 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.34 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  45.54 
 
 		 175 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 265 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 		 263 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40.18 
 
 		 260 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  41.96 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  41.59 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  37.5 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 159 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  41.03 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  41.03 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 168 aa  83.6  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 174 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.48 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.61 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  38.18 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  38.18 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.03 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.17 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.17 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  36 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.71 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 		 315 aa  80.1  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  32.31 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  38.39 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.54 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  38.39 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>