More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2573 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  100 
 
 
338 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  93.11 
 
 
336 aa  603  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  82.88 
 
 
343 aa  551  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  60.49 
 
 
341 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  56.97 
 
 
358 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  55.89 
 
 
344 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.56 
 
 
350 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.52 
 
 
341 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.12 
 
 
352 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.26 
 
 
353 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.26 
 
 
353 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.26 
 
 
353 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  61.64 
 
 
349 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  57.7 
 
 
349 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.95 
 
 
363 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  55.45 
 
 
346 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  54.95 
 
 
352 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.85 
 
 
338 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  56.42 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  57.01 
 
 
344 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.47 
 
 
342 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.43 
 
 
342 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.73 
 
 
339 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  53.01 
 
 
351 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.36 
 
 
340 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.27 
 
 
347 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.69 
 
 
350 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.98 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.15 
 
 
353 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.61 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.61 
 
 
348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.31 
 
 
350 aa  335  7e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.85 
 
 
339 aa  335  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.06 
 
 
346 aa  335  9e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3321  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
358 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111533  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.71 
 
 
345 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.75 
 
 
348 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.33 
 
 
348 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.68 
 
 
343 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3340  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.44 
 
 
345 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3808  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.17 
 
 
354 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1187  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.96 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  54.1 
 
 
340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0938  pyruvate carboxyltransferase  53.33 
 
 
344 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.4 
 
 
337 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.27 
 
 
352 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.05 
 
 
342 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2781  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.13 
 
 
344 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.018657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1390  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.82 
 
 
339 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.82 
 
 
349 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.47 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.82 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4142  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.66 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345683  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.55 
 
 
337 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  52.55 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.55 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.55 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.55 
 
 
337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.55 
 
 
337 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1479  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  51.2 
 
 
346 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2266  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.47 
 
 
349 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1356  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.52 
 
 
341 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315609  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3782  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.52 
 
 
343 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.132255  hitchhiker  0.000807704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.82 
 
 
340 aa  318  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.25 
 
 
337 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.25 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  52.25 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.98 
 
 
339 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.22 
 
 
343 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  53.21 
 
 
349 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.13 
 
 
338 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.89 
 
 
345 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.75 
 
 
349 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.51 
 
 
345 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.6 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.21 
 
 
343 aa  312  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1457  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  53.5 
 
 
343 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322721  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.06 
 
 
340 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.39 
 
 
342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  50.46 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.82 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1245  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  45.35 
 
 
333 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.84 
 
 
338 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  52.1 
 
 
338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
337 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.66 
 
 
349 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50.45 
 
 
336 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.77 
 
 
349 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  48.77 
 
 
349 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  49.25 
 
 
342 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  50 
 
 
337 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3900  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.86 
 
 
351 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.577323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3025  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  45.09 
 
 
333 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3525  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  51.57 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4833  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  44.62 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4567  pyruvate carboxyltransferase  42.55 
 
 
348 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000479779 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.94 
 
 
347 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.94 
 
 
347 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.94 
 
 
347 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  39.63 
 
 
347 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>