145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4259 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4259  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 124 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4687  isochorismatase hydrolase  81.55 
 
 		 225 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5828  isochorismatase hydrolase  78.64 
 
 		 225 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2191  isochorismatase hydrolase  71.15 
 
 		 226 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.491349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3983  isochorismatase hydrolase  69.23 
 
 		 226 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2062  isochorismatase hydrolase  68.27 
 
 		 226 aa  150  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3985  SlsA  67.96 
 
 		 226 aa  147  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4090  hypothetical protein  67.96 
 
 		 226 aa  147  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0145098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3966  SlsA  67.96 
 
 		 226 aa  147  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4153  hypothetical protein  67.96 
 
 		 226 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.870386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4039  hypothetical protein  67.96 
 
 		 226 aa  147  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.476407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0956  SlsA  66.02 
 
 		 225 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.46414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1065  SlsA  66.02 
 
 		 225 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0984  hypothetical protein  66.02 
 
 		 225 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1050  hypothetical protein  66.02 
 
 		 225 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.11597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1016  hypothetical protein  66.02 
 
 		 225 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1974  isochorismatase hydrolase  65.38 
 
 		 226 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2887  isochorismatase hydrolase  62.14 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597851  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2840  putative hydrolase  65.05 
 
 		 226 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33420  putative hydrolase  64.08 
 
 		 226 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.174532  normal  0.0254919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2682  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1103  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2942  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2916  isochorismatase superfamily hydrolase  35.56 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3166  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3174  isochorismatase family protein  35.56 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3014  hydrolase  42.19 
 
 		 209 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.446306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2089  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 214 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1435  isochorismatase hydrolase  40.3 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.544565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0106  isochorismatase hydrolase  42.19 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3151  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3160  isochorismatase family protein  34.44 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.217424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1858  amidase  42.19 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000146325  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5454  isochorismatase hydrolase  34.21 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.532525  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1338  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 216 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781406  normal  0.20324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3097  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.671486  normal  0.266258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2389  putative isochorismatase hydrolase  34.33 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3161  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2917  isochorismatase  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3152  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2088  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3175  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2943  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3167  isochorismatase family protein  40.28 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.248835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4813  isochorismatase hydrolase  39.06 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1179  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.225361  normal  0.599787 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0905  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 224 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.287492  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5243  isochorismatase superfamily hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5720  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5153  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  32.47 
 
 		 217 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1343  isochorismatase family protein  40.62 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3207  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 		 250 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2301  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000167254  hitchhiker  0.00473367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0229  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1967  isochorismatase hydrolase  31.82 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2298  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2690  hypothetical protein  36 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3570  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411732  normal  0.268452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4176  putative hydrolase  31.76 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0770889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4681  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.57989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48760  putative hydrolase  30.59 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289915 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6133  isochorismatase hydrolase  31.34 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.807443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2583  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4267  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.450558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4273  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.349608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1009  isochorismatase family protein  29.87 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31440  hydrolase, isochorismatase family  33.33 
 
 		 215 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2573  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1779  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2888  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724068  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_003296  RS01788  hypothetical protein  38.1 
 
 		 212 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  0.622692 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00901  predicted hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.460516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2746  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00908  hypothetical protein  31.17 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.406743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2699  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0242  isochorismatase  38.1 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4761  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2390  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4572  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 212 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333323  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0973  isochorismatase hydrolase family protein  31.17 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1059  isochorismatase family protein  31.17 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2223  isochorismatase family protein  31.17 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4687  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3473  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0622536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4314  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4052  isochorismatase hydrolase  39.34 
 
 		 212 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1137  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1001  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 208 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2192  isochorismatase hydrolase  36.51 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0480  isochorismatase hydrolase  38.1 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0594  isochorismatase superfamily hydrolase  40.32 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5596  putative isochorismatase family protein  34.43 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.247182 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>