269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3638 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3638  ferredoxin  100 
 
 		 119 aa  248  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  75.82 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  71.43 
 
 		 92 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4347  ferredoxin  68.48 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  39.24 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3214  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.65 
 
 		 408 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3759  ferredoxin  32.61 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.94 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.73 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.73 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.73 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0816  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.71 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.709855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1716  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.16 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0915983  normal  0.0536811 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3412  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.82 
 
 		 407 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0792891  normal  0.513538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  34.02 
 
 		 434 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20190  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.58 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.864548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  32.53 
 
 		 598 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  34.02 
 
 		 437 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1802  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  33.33 
 
 		 407 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0589652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2960  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.12 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.97 
 
 		 396 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.04 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3636  ferredoxin  31.18 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  32.58 
 
 		 407 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.05 
 
 		 372 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2965  ferredoxin  35.29 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4349  ferredoxin  30.43 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.34 
 
 		 407 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.58 
 
 		 358 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.58 
 
 		 358 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09330  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31 
 
 		 371 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.46 
 
 		 369 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  24.73 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  23.4 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  23.4 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  23.4 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.34 
 
 		 407 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.57 
 
 		 360 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3155  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.85 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.46 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  39.39 
 
 		 592 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.3 
 
 		 369 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  35.82 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.34 
 
 		 407 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.78 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1824  putative ferredoxin  32.61 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.213573  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.46 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.65 
 
 		 344 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.56 
 
 		 592 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  45.45 
 
 		 612 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.53 
 
 		 357 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  35.8 
 
 		 558 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  31.82 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  28.05 
 
 		 356 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  30.69 
 
 		 355 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3633  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.23 
 
 		 341 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  23.4 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 		 752 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  31.87 
 
 		 652 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  33.75 
 
 		 650 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6688  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.82 
 
 		 341 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  39.08 
 
 		 612 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.59 
 
 		 346 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.59 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  30.49 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0269  ferredoxin  30.68 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  28.87 
 
 		 685 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  24.47 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2384  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.82 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  31.4 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  30.59 
 
 		 343 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0648  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.76 
 
 		 365 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  34.09 
 
 		 355 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  36.71 
 
 		 644 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  35.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  33.73 
 
 		 638 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.77 
 
 		 592 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  24.73 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  24.73 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.67 
 
 		 340 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.21 
 
 		 336 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2429  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  31.33 
 
 		 411 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.14 
 
 		 358 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.78 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  33.85 
 
 		 325 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  27.16 
 
 		 570 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1926  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  35.85 
 
 		 408 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.300144  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  25.74 
 
 		 344 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0095  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.12 
 
 		 412 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.67 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  27.96 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  23.66 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  23.66 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  25.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  41.38 
 
 		 612 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.67 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  26.25 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  34.21 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  26.6 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>