249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1210 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  100 
 
 		 298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  92.28 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  91.61 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  91.61 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  91.61 
 
 		 298 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  90.94 
 
 		 298 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  90.27 
 
 		 298 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  90.6 
 
 		 336 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  90.6 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  90.27 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  82.89 
 
 		 302 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  82.94 
 
 		 302 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  81.61 
 
 		 303 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  76.19 
 
 		 294 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  75.85 
 
 		 296 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  76.19 
 
 		 296 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  75.77 
 
 		 295 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  75.43 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  75.68 
 
 		 295 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  75.51 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  72.6 
 
 		 313 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 312 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  60.27 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  60.61 
 
 		 299 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  54.08 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  58.72 
 
 		 299 aa  319  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  58.67 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.4 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.4 
 
 		 294 aa  298  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  58.89 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  58.19 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  55.9 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  51.18 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  52.04 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  52.03 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  53.22 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  46.27 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  50.18 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  46.95 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  50.86 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  46.02 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  48.65 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.16 
 
 		 330 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.91 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  42.24 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  42.24 
 
 		 305 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  47.3 
 
 		 640 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.25 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.87 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  42.61 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  39.49 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 365 aa  185  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.28 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.47 
 
 		 584 aa  148  9e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  58.16 
 
 		 120 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  26.97 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  23.86 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.72 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  27.97 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  27.78 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  27.78 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  28.11 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  27.82 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  22.77 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  29.61 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  29.61 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  22.77 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  25.57 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.61 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  27.7 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0518  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  27.86 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  24.72 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.23 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>