More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6904 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  78.62 
 
 
569 aa  893    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  83.27 
 
 
554 aa  958    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  69.6 
 
 
561 aa  778    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  72.94 
 
 
556 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  80.84 
 
 
569 aa  902    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  72.29 
 
 
590 aa  816    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  70.68 
 
 
561 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  100 
 
 
556 aa  1150    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  89.93 
 
 
555 aa  1030    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.15 
 
 
510 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  34.16 
 
 
564 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  35.7 
 
 
524 aa  250  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  32.71 
 
 
513 aa  246  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  34.89 
 
 
526 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  35.06 
 
 
515 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  33.16 
 
 
521 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  33.27 
 
 
508 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  34.39 
 
 
505 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  34.34 
 
 
508 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  34.02 
 
 
505 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  32.83 
 
 
547 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.78 
 
 
546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  33.07 
 
 
522 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  33.53 
 
 
552 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  34.59 
 
 
502 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  33 
 
 
557 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  33.01 
 
 
567 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  33.27 
 
 
545 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  34.31 
 
 
554 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  31.73 
 
 
542 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  33.6 
 
 
522 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  33.2 
 
 
544 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  32.35 
 
 
552 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  31.68 
 
 
512 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  32.53 
 
 
496 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  32.06 
 
 
560 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  33.71 
 
 
517 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  33.93 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  32.69 
 
 
579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  32.67 
 
 
522 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  32.23 
 
 
514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  32.23 
 
 
514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  31.7 
 
 
555 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  31.26 
 
 
525 aa  209  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.16 
 
 
470 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  33.4 
 
 
512 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.35 
 
 
440 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  31.51 
 
 
505 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  30.9 
 
 
512 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  32.47 
 
 
549 aa  205  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.73 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.73 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.73 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.94 
 
 
548 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  31.12 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  31.12 
 
 
551 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  29.31 
 
 
533 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30.12 
 
 
550 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.63 
 
 
480 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.19 
 
 
466 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.69 
 
 
462 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  35.5 
 
 
543 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  30.8 
 
 
525 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.49 
 
 
486 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.53 
 
 
452 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  29.87 
 
 
496 aa  170  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  31.74 
 
 
520 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.75 
 
 
500 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.74 
 
 
506 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  29.56 
 
 
503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.58 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.15 
 
 
487 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.31 
 
 
495 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.34 
 
 
553 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  29.32 
 
 
526 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.9 
 
 
458 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.29 
 
 
497 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.67 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  30 
 
 
548 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.35 
 
 
491 aa  153  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.65 
 
 
497 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.01 
 
 
501 aa  151  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  28.28 
 
 
453 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  30.06 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  28.45 
 
 
479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.46 
 
 
497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.01 
 
 
526 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.46 
 
 
497 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.6 
 
 
497 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  29.41 
 
 
488 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.6 
 
 
497 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.4 
 
 
468 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.71 
 
 
559 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.77 
 
 
522 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.91 
 
 
482 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.14 
 
 
491 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.07 
 
 
481 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  29.18 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  27.81 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.07 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>