46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6789 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1554 aa  3149    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.12 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  27.92 
 
 		 1619 aa  59.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  32 
 
 		 654 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  25.59 
 
 		 442 aa  57.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 		 941 aa  56.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.81 
 
 		 579 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 1088 aa  56.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1153  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.46 
 
 		 278 aa  56.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  30.67 
 
 		 670 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.98 
 
 		 578 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 		 578 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  30.21 
 
 		 587 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  29.23 
 
 		 331 aa  53.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.6 
 
 		 1760 aa  52.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 		 316 aa  52  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 		 1686 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 1557 aa  51.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  27.37 
 
 		 770 aa  50.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 		 729 aa  50.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.48 
 
 		 445 aa  50.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.48 
 
 		 445 aa  50.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  38.27 
 
 		 765 aa  50.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.34 
 
 		 1196 aa  50.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 244 aa  50.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.14 
 
 		 1004 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 355 aa  49.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.39 
 
 		 633 aa  49.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 		 489 aa  49.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  33.57 
 
 		 898 aa  48.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.67 
 
 		 1557 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 		 658 aa  48.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 1240 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 		 925 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.06 
 
 		 1711 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 261 aa  47.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 		 490 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 393 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 487 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.56 
 
 		 971 aa  46.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 795 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5561  hypothetical protein  23.56 
 
 		 619 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.27855e-47 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 795 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  30.56 
 
 		 971 aa  46.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.78 
 
 		 464 aa  45.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  26.8 
 
 		 328 aa  45.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>