More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5000 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5000  putative esterase/lipase/thiestherase protein  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101002  normal  0.508261 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5258  hypothetical protein  39.49 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4489  putative esterase  33.33 
 
 
301 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5183  putative esterase  30.86 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1759  hypothetical protein  34.16 
 
 
278 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0504  hypothetical protein  34.16 
 
 
278 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.368816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0652  hypothetical protein  34.16 
 
 
269 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1370  esterase/lipase  34.16 
 
 
269 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.194739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1738  hypothetical protein  33.19 
 
 
275 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3168  putative esterase  37.5 
 
 
288 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000470113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1574  hypothetical protein  34.16 
 
 
278 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792028  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0624  putative esterase  32.95 
 
 
296 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0312234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1402  putative esterase  31.27 
 
 
324 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2835  hypothetical protein  33.64 
 
 
284 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.626862  normal  0.879431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1624  esterase/lipase-like protein  31.25 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0914891  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1599  hypothetical protein  33.74 
 
 
278 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2366  putative esterase  32.17 
 
 
287 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1602  esterase/lipase-like protein  30.47 
 
 
268 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.872015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1666  esterase/lipase-like protein  32.81 
 
 
275 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658867  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1215  esterase/lipase-like protein  31.25 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1694  esterase/lipase-like protein  31.25 
 
 
275 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2955  hypothetical protein  31.38 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4855  esterase/lipase-like protein  30.86 
 
 
304 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0316835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2976  hypothetical protein  32.27 
 
 
303 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1533  hypothetical protein  33.21 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5243  putative esterase  32.57 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.601639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2004  putative esterase/lipase  29.55 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0400  hypothetical protein  31.82 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  0.731684 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1263  hypothetical protein  32.8 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00802611  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1716  hypothetical protein  35.18 
 
 
285 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2822  hypothetical protein  35.98 
 
 
313 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1199  putative esterase/lipase  34.07 
 
 
280 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2702  hypothetical protein  31.16 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3090  esterase/lipase-like protein  30.04 
 
 
264 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18460  hypothetical protein  29.74 
 
 
296 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3448  putative esterase/lipase  32.89 
 
 
284 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666371 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1183  hypothetical protein  26.12 
 
 
271 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.716551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1658  hypothetical protein  29.92 
 
 
305 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5100  esterase/lipase-like protein  31.66 
 
 
272 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0649  esterase/lipase-like protein  34.42 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.658651  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2125  Arylformamidase  30 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1997  carboxylesterase family protein  29.64 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3788  hypothetical protein  32.2 
 
 
276 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5829  esterase  33.55 
 
 
289 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000904381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1431  esterase/lipase-like protein  30.61 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0322  hypothetical protein  31.91 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.104555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.26 
 
 
300 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1906  hypothetical protein  28.28 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000217511  normal  0.0142831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4843  esterase/lipase/thioesterase family protein  36.55 
 
 
302 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3396  hypothetical protein  29.13 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1645  hypothetical protein  25.82 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0814  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.02 
 
 
336 aa  85.5  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.167349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2754  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.77 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1550  esterase  31.87 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00157882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6510  putative hydrolase (Serine esterase)  26.91 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149214  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  33.73 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  33.73 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  33.73 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1552  carboxylesterase family protein  33.73 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0551144  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1356  carboxylesterase family protein  33.73 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0183  carboxylesterase family protein  33.73 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0258  hypothetical protein  26.55 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2196  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.87 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.266985  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2888  putative alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000241546  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01721  hypothetical protein  24.46 
 
 
308 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.71 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5847  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.29 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2671  putative esterase/lipase/thioesterase  32.98 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1779  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.05 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0322444  normal  0.374149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0220  esterase/lipase-like protein  30.21 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2292  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.01 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0469  carboxylesterase family protein  36.9 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  29.19 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1010  esterase/lipase/thioesterase  32.29 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1110  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.09 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3417  esterase/lipase-like protein  33.18 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0214076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  27.66 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1821  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.52 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.990193  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92448  predicted protein  30.37 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.492816  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0276  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.68 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0231  esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.272912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1114  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.68 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000135139 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  31.97 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.45 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4004  hypothetical protein  25.74 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0172  putative esterase  26.79 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.32739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0811  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.28797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1930  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.58 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2206  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.58 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2026  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.53 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2492  putative esterase/lipase/thioesterase  25.23 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.377015 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0169  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.51 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1511  esterase/lipase-like  34.51 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000319912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5201  lipase/esterase  30.16 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000263109  normal  0.0797568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0856  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.12 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94876  normal  0.248817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5035  putative esterase/lipase  32 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465698  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1153  putative esterase  30.19 
 
 
208 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0591042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3812  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.95 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422077  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2682  esterase/lipase/thioesterase  32.8 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>