32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4470 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  91.71 
 
 
193 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  48.89 
 
 
194 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  46.02 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  31.18 
 
 
182 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  30.99 
 
 
183 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  29.85 
 
 
205 aa  95.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  32.39 
 
 
194 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  35.42 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  32.43 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  32.2 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  34.15 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  29.8 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  30.97 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  29.94 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  28.07 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  30.26 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  32.98 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  25.93 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  28.57 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  32.04 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  26.04 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  32.12 
 
 
223 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  29.37 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  32.39 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  30.5 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3443  hypothetical protein  25.41 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.142737  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  36.51 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  34.92 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2054  hypothetical protein  24.32 
 
 
178 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941443  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0401  hypothetical protein  24.32 
 
 
178 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  33.33 
 
 
181 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>