More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6556 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6556  ABC transporter related  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240433  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6141  ABC transporter related  90.42 
 
 
262 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0166559 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0734  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.43 
 
 
251 aa  241  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3965  ABC transporter related  56.91 
 
 
251 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0247  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.42 
 
 
542 aa  218  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19570  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  45.45 
 
 
332 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal  0.0690527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.64 
 
 
545 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.9 
 
 
545 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.63 
 
 
553 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  42.6 
 
 
542 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
550 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  44.88 
 
 
548 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  43.63 
 
 
542 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 
541 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  41.92 
 
 
606 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36500  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  44.79 
 
 
332 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.632882  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  43.17 
 
 
538 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  44.57 
 
 
534 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  44.88 
 
 
609 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4863  ABC transporter ATP-binding protein, putative oligo/dipeptide transport protein  46.48 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3919  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.73 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2715  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00148144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  45.74 
 
 
571 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2384  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
346 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4477  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.178074  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  45.35 
 
 
579 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1801  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00628177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 
325 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1093  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2456  ABC transporter related  44.36 
 
 
566 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 
337 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.276741  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
330 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  44.66 
 
 
534 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2989  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5775  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0511642  normal  0.641423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  42.59 
 
 
557 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2602  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  45.87 
 
 
569 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  42.23 
 
 
534 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0219  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
352 aa  195  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.580766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5789  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
327 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  41.86 
 
 
533 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
536 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5644  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.87 
 
 
331 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.364667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2854  putative oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 
327 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.609157  normal  0.248149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.57 
 
 
347 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 
536 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6445  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
335 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134411  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3106  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
330 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.236383  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  42.21 
 
 
557 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  41.44 
 
 
533 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2850  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
342 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.61 
 
 
564 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2970  ABC transporter related  43.8 
 
 
538 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382736  normal  0.018129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  41.5 
 
 
533 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5135  peptide ABC transporter, ATP binding protein, oppD-like protein  51.74 
 
 
332 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0447152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 
332 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2837  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.34 
 
 
335 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 
545 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  41.89 
 
 
531 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.78 
 
 
347 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.64 
 
 
343 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.7 
 
 
610 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1009  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
341 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  42.64 
 
 
545 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  43.53 
 
 
545 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  42.64 
 
 
625 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
347 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
703 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  42.91 
 
 
619 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0982  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
564 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  42.97 
 
 
543 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  47.83 
 
 
540 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
334 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5292  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.8 
 
 
277 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0944  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
338 aa  191  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  43.94 
 
 
543 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  42.97 
 
 
543 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 
360 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 
342 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1006  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.19 
 
 
360 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  43.03 
 
 
586 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.67 
 
 
322 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  47.23 
 
 
566 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
543 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1310  ABC transporter related  45.65 
 
 
544 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0559382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  46.75 
 
 
603 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0572  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  39.62 
 
 
359 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  41.47 
 
 
533 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0258  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 
369 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21107  hitchhiker  0.00186556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 
347 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.22 
 
 
322 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>