More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6102 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6102  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4378  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2790  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.709673  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5342  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0863974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4485  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2639  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96958  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  33.44 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  31.65 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  28.18 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  29 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  29.55 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  30.84 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  30 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.55 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 291 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.33 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  30.56 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  31 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.57 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.57 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  29.57 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.9 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  26.82 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.66 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  28.38 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  28 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.9 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.71 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.48 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.52 
 
 		 298 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  28.66 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  28.48 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.48 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  28.34 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  30.35 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  26.73 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  29.37 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  28.67 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  28.09 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.57 
 
 		 308 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  32.24 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  30.46 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  27.65 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  26.42 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  27.3 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  26.35 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0734  inner-membrane translocator  28.79 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993171  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03306  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4774  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  27.06 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  27.61 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  27.51 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  30.59 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3655  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  27.67 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1761  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328925  hitchhiker  0.000752559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3335  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4423  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 652 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>