54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4073 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  100 
 
 		 662 aa  1380    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  55.23 
 
 		 655 aa  745    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  42.79 
 
 		 688 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  33.47 
 
 		 729 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  34.41 
 
 		 615 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  33.86 
 
 		 618 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  33.83 
 
 		 619 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  34.24 
 
 		 616 aa  357  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  35.59 
 
 		 689 aa  351  2e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  33.79 
 
 		 616 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  33.38 
 
 		 618 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  34.82 
 
 		 670 aa  331  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  35.5 
 
 		 688 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  29.63 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  31.76 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  32.04 
 
 		 571 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  31.65 
 
 		 577 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  26.64 
 
 		 658 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.51 
 
 		 757 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  32.88 
 
 		 241 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.88 
 
 		 241 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  32.88 
 
 		 241 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  26.82 
 
 		 346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  30.49 
 
 		 247 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  26.34 
 
 		 346 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 346 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  26.34 
 
 		 346 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  28.19 
 
 		 211 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.42 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  24.46 
 
 		 883 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.21 
 
 		 211 aa  51.6  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  24.68 
 
 		 229 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  26.7 
 
 		 318 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4087  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1338  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 75 aa  47.8  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.207335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  25.91 
 
 		 319 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.48 
 
 		 227 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 319 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  23.75 
 
 		 884 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  24.56 
 
 		 350 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  27.13 
 
 		 916 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  28.36 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  24.82 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  24.46 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  27.99 
 
 		 321 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  24.68 
 
 		 511 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 321 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  26.54 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  27.99 
 
 		 321 aa  44.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  26.83 
 
 		 306 aa  44.3  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 266 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  26.82 
 
 		 315 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  28.98 
 
 		 312 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>