140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4051 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  924    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  50.37 
 
 		 403 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  31.6 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  30.31 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 330 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  36.4 
 
 		 319 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  36.07 
 
 		 331 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  27.65 
 
 		 399 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  27.69 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  24.27 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2302  HD domain-containing protein  24.89 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.332838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  28.32 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  27.69 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  26.8 
 
 		 414 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  22.79 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2680  HD-GYP domain-containing protein  25.66 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.467072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  25.14 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  22.9 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  28.99 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0886  metal dependent phosphohydrolase  25.16 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.286498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  24.15 
 
 		 401 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2862  HDIG domain-containing protein  23.79 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  26.26 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  22.55 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0730  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0424443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  23.22 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1510  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.933649  hitchhiker  0.00011733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1577  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1571  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000899891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2630  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  24.9 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2333  hypothetical protein  23.15 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  22.59 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.23 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  24.12 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  23.33 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  24.79 
 
 		 349 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  25.35 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  22.31 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  20.91 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  25.64 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  25.54 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  22.07 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  21.89 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2511  hypothetical protein  25.93 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  23.76 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  22.55 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  24.48 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0563  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  22.83 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  23.38 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  26.57 
 
 		 419 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0251  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2362  metal dependent phosphohydrolase  24.75 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.014285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  25.11 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>