25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1214 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1022    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1058  hypothetical protein  27.6 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  25.34 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  27.71 
 
 		 569 aa  57  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  32 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  26.88 
 
 		 636 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  23.28 
 
 		 579 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  28.83 
 
 		 628 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  38.96 
 
 		 591 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  26.32 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  26.09 
 
 		 316 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  30.38 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  46.94 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  33.93 
 
 		 582 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  23.44 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  54.55 
 
 		 338 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  23.11 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  25.3 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  28.21 
 
 		 597 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  26.24 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  48.48 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  48.48 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  48.48 
 
 		 609 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  25 
 
 		 569 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  42.42 
 
 		 610 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>