More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1153 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1153  OmpA/MotB  100 
 
 
181 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.19 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.5 
 
 
169 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  50 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1372  OmpA family outer membrane protein  48.28 
 
 
170 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.5 
 
 
176 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.4 
 
 
170 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  49.4 
 
 
170 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  49.4 
 
 
170 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  47.9 
 
 
169 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.73 
 
 
180 aa  157  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0758  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.08 
 
 
169 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.620729  normal  0.624777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4052  OmpA/MotB  50.32 
 
 
180 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3921  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.47 
 
 
169 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315585  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3204  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0826  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2082  OmpA family outer membrane protein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3257  OmpA family outer membrane protein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1950  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3242  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.676059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  56.67 
 
 
169 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2660  peptidoglycan-associated outer-membrane lipoprotein  47.13 
 
 
170 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.305676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  48.07 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  57.94 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  48.02 
 
 
180 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.02 
 
 
180 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0685  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.83 
 
 
173 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.289483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2338  OmpA/MotB  46.59 
 
 
180 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000002945  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3831  peptidoglycan-associated lipoprotein  60.53 
 
 
182 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.79 
 
 
163 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  55.83 
 
 
172 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0729  peptidoglycan-associated lipoprotein  55 
 
 
173 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0152345  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  43.89 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.4 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.11 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  52.11 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  52.11 
 
 
163 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0302  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.02 
 
 
166 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.519391  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2205  outer membrane protein, porin-associated lipoprotein  59.26 
 
 
188 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.604308  hitchhiker  0.00226867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.65 
 
 
163 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  49.65 
 
 
163 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  49.71 
 
 
177 aa  140  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  53.04 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.79 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1012  OmpA domain-containing protein  42.54 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0567  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.24 
 
 
188 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22731  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2713  OmpA/MotB  53.39 
 
 
175 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.202213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0274  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
167 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00497769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
184 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2081  OmpA/MotB domain-containing protein  41.52 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0638605  normal  0.21469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  58.65 
 
 
196 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  41.12 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0781  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.24 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2925  OmpA/MotB  44 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.407293  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0146  OmpA/MotB  51.72 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  53.04 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1230  OmpA family protein  47.83 
 
 
215 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.337438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1347  putative peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  41.67 
 
 
179 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  41.77 
 
 
165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2228  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein-like protein  41.67 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.53 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0784  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 
163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0131111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.58 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1069  outer membrane protein P6 precursor  38.55 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.427526  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  35.88 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1474  OmpA/MotB domain-containing protein  37.43 
 
 
163 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  36.9 
 
 
187 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2018  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.46 
 
 
195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.590364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0176  putative peptidoglycan-associated lipoprotein  50.46 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.340213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  40.67 
 
 
194 aa  111  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  47.57 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  38.12 
 
 
193 aa  110  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.86 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.86 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  38.86 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.14 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.96 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0562  peptidoglycan-associated lipoprotein  50 
 
 
127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  35 
 
 
173 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0950  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.37 
 
 
179 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.660653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1463  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 
178 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000146392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  49.52 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.2 
 
 
172 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2195  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.04 
 
 
192 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.203407  normal  0.247452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  39.1 
 
 
177 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
189 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.57 
 
 
173 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  36.91 
 
 
148 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0899  OmpA/MotB  47.06 
 
 
205 aa  105  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.71 
 
 
168 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  37.71 
 
 
168 aa  104  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>