99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6482 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  41.46 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  40.68 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  29.63 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  30.83 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  31.09 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  35.34 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  32.03 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  36.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  36.7 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  36.75 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000585754  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  36.19 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.98 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  36.94 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  36.94 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  36.94 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  35.65 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  27.48 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  34.23 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  33.06 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  31.75 
 
 		 312 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  27.12 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.2 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  30.77 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35.9 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.35 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.05 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  28.33 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31 
 
 		 311 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  30 
 
 		 548 aa  57  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  34.58 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  25.64 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  25.21 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  25.21 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  26.5 
 
 		 319 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.77 
 
 		 319 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  29.75 
 
 		 324 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  26.89 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  33.64 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.76 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  30.17 
 
 		 315 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  29.6 
 
 		 322 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  30.65 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.25 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  26.72 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  26.05 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1511  hypothetical protein  28.93 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  28.1 
 
 		 317 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  28.1 
 
 		 318 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  23.77 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30.33 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  36.96 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4633  hypothetical protein  30.4 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  28.46 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  29.85 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  30.48 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.73 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  29.57 
 
 		 550 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  29.57 
 
 		 550 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  32.58 
 
 		 144 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  29.57 
 
 		 550 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  27.93 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0885  protein of unknown function DUF35  30.6 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  30.17 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.51 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.16 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  28.18 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  29.82 
 
 		 134 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.23 
 
 		 134 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  29.25 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  27.78 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  30.16 
 
 		 139 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>