More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2723 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0804  acetylornithine transaminase protein  76.4 
 
 		 394 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2435  acetylornithine transaminase protein  84.09 
 
 		 399 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1967  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00040432  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2723  acetylornithine transaminase protein  100 
 
 		 395 aa  809    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0946  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1150  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0464623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0996  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0277108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5823  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 		 394 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258448  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0989  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000186323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0827  acetylornithine transaminase protein  79.7 
 
 		 394 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2703  acetylornithine transaminase protein  84.81 
 
 		 395 aa  688    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2862  acetylornithine transaminase protein  92.15 
 
 		 395 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543717  normal  0.885831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1880  acetylornithine transaminase protein  77.41 
 
 		 394 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2516  acetylornithine transaminase protein  77.66 
 
 		 394 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3139  acetylornithine transaminase protein  78.68 
 
 		 394 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0879  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000764402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2313  acetylornithine transaminase protein  84.81 
 
 		 395 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.69207  hitchhiker  0.000535331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0269  acetylornithine transaminase protein  78.43 
 
 		 394 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0277615  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2491  acetylornithine transaminase protein  77.41 
 
 		 394 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2409  acetylornithine transaminase protein  76.65 
 
 		 394 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.1075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2538  acetylornithine transaminase protein  76.9 
 
 		 394 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.284603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0594  acetylornithine transaminase protein  76.65 
 
 		 394 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0791  acetylornithine transaminase protein  77.92 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1443  acetylornithine transaminase protein  75 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1725  acetylornithine transaminase protein  74.23 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1679  acetylornithine transaminase protein  67.94 
 
 		 395 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0065  acetylornithine transaminase protein  63.23 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4143  acetylornithine transaminase protein  60.91 
 
 		 398 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1612  aminotransferase class-III  55.41 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0632  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  46.75 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0372  aminotransferase class-III  47.31 
 
 		 426 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.606952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0398  aminotransferase class-III  47.31 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06920  putative class III pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase  46.23 
 
 		 393 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4830  aminotransferase class-III  47.15 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0402  aminotransferase class-III  46.55 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  45.5 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  46.27 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.65 
 
 		 399 aa  329  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  45.08 
 
 		 396 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.08 
 
 		 399 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  44.42 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  42.86 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.99 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  45.41 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.34 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  43.73 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 		 387 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5164  aminotransferase  45.21 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 395 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.94 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  43.44 
 
 		 396 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1443  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.96 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.82 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  45.31 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2466  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.96 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.841609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1995  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.96 
 
 		 406 aa  292  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.88 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0185  acetylornithine transaminase protein  47.43 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.372078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1831  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.68 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01717  succinylornithine transaminase, PLP-dependent  43.41 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  42.86 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01705  hypothetical protein  43.41 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1894  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.41 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.433032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1884  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.41 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3616  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.88 
 
 		 403 aa  289  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1970  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.41 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0832  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.51 
 
 		 400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0150295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  41.79 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2733  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  42.09 
 
 		 404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  43.18 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  44.01 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00079  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.41 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.71 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002275  acetylornithine aminotransferase/N-succinyl-L,L-diaminopimelate aminotransferase/succinylornithine transaminase  40.41 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1696  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.76 
 
 		 406 aa  282  8.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  42.07 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.01 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.83 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2121  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.94 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.62 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2520  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.94 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2844  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  41.42 
 
 		 404 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285049  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  43.19 
 
 		 398 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1837  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.15 
 
 		 401 aa  279  6e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2229  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  40.94 
 
 		 446 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  41.81 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.25 
 
 		 427 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2195  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.58 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  40.66 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4620  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  40.47 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1054  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.46 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2043  bifunctional succinylornithine transaminase/acetylornithine transaminase  43.53 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>