44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1376 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  53.85 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  49.38 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  50 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1638  hypothetical protein  44 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.538048  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1313  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.113524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  33.64 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  38.14 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0107  hypothetical protein  35.51 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3428  VanZ family protein  40.38 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0239273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  40.66 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  34.04 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3602  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  32.73 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3725  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3534  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479374  hitchhiker  0.0000727647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0709  VanZ family protein  33.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  38.38 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  36.89 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1976  VanZ family protein  38.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.999512  normal  0.218225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  30.53 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0781  VanZ family protein  36.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0404681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0810  VanZ family protein  36.14 
 
 		 120 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3157  VanZ family protein  36.14 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0778  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.975844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0817  VanZ family protein  32.38 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3816  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  34 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1394  VanZ family protein  31.25 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3647  VanZ family protein  29.76 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0310294  normal  0.0362652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  33.93 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  35.44 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  36.19 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  36.19 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1795  VanZ family protein  39.13 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.09464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2014  hypothetical protein  34.57 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  30.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0769  hypothetical protein  30.25 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01200  hypothetical protein  32.63 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0484  VanZ family protein  37.65 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  34.65 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0477  hypothetical protein  36 
 
 		 100 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34 
 
 		 392 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2558  hypothetical protein  33.96 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.308425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>