36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4068 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  858    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.233618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0605  hypothetical protein  60.28 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0557  hypothetical protein  29.49 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3232  hypothetical protein  28.05 
 
 		 406 aa  93.2  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000018306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.86 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.75 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  29.44 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  30 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  30 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  30 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  30 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  30 
 
 		 433 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  28.89 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  28.89 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36640  translocation protein TolB  29.12 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  29.83 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  29.08 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.34 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  25.31 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  27.8 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 734 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.02 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  27.84 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  30.41 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  25.7 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.8 
 
 		 440 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25.83 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.53 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>