More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3618 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 122 aa  248  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  70 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  48.28 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  48.91 
 
 		 105 aa  87  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  45.12 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  48.19 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  48.19 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  44.29 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  44.71 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  42.25 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  45.71 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  37.27 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  36.73 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  46.05 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  49.33 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  39.77 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  36.84 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.34 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1710  regulatory protein, ArsR  43.84 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000198006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  43.84 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  42.5 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  39.51 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  35.16 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  46.97 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  36.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  36.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>