More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2353 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2353  ABC transporter related  100 
 
 
309 aa  628  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.341379  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2474  ABC transporter related  90.14 
 
 
299 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471366  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3594  ABC transporter related  69.13 
 
 
299 aa  363  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1439  ABC transporter related protein  60.22 
 
 
299 aa  335  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  56.25 
 
 
294 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0405  ABC transporter related  56.43 
 
 
270 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1793  ABC transporter-like protein  49.45 
 
 
270 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1953  ABC transporter related protein  51.45 
 
 
272 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00018631  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
325 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 
328 aa  192  5e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.17 
 
 
338 aa  192  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  46.32 
 
 
257 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.81 
 
 
328 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 
328 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
330 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 
329 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.87 
 
 
338 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.89 
 
 
339 aa  186  6e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.39 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.08 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  38.29 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  44.93 
 
 
334 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
326 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.16 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 
308 aa  179  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.9 
 
 
324 aa  179  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
330 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
266 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 
327 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.02 
 
 
333 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.81 
 
 
324 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.15 
 
 
334 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
374 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 
347 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
353 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  48 
 
 
314 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 
330 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 
321 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.54 
 
 
321 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 
325 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 
333 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.73 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.18 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.94 
 
 
345 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.4 
 
 
322 aa  172  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 
331 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.17 
 
 
334 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.09 
 
 
325 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  39.57 
 
 
303 aa  170  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  43.54 
 
 
332 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  42.31 
 
 
314 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
347 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  44.29 
 
 
287 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
308 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.38 
 
 
312 aa  168  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.14 
 
 
324 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  39.62 
 
 
309 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  43.48 
 
 
330 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
368 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 
320 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.07 
 
 
323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.37 
 
 
323 aa  166  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
351 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 
324 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 
446 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  35.66 
 
 
290 aa  165  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.49 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  36.69 
 
 
590 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.24 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  33.47 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.39 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 
305 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.1 
 
 
257 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.9 
 
 
318 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
411 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  35.71 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  40.29 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.24 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  38.46 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  41.83 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.57 
 
 
280 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.45 
 
 
312 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
313 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
251 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
262 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  35.66 
 
 
318 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  41.83 
 
 
341 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 
308 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  37.92 
 
 
257 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 
354 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.42 
 
 
305 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 
293 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>