27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2152 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1036    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  80.35 
 
 		 516 aa  755    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  44.51 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  31.99 
 
 		 496 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  28.35 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  22.36 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24.53 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.29 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  25.85 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  23.32 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.03 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6965  VanW family protein  34.33 
 
 		 892 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.4 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  22.45 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  38 
 
 		 282 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  20.7 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2379  VanW family protein  27.78 
 
 		 675 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.548137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1126  VanW family protein  41.54 
 
 		 772 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  36 
 
 		 283 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  22.18 
 
 		 323 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2755  VanW family protein  31.03 
 
 		 670 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  21.51 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  25.77 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0758  VanW family protein  25.32 
 
 		 1355 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.115824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  20.23 
 
 		 286 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  27.03 
 
 		 320 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0345  VanW family protein  29.14 
 
 		 781 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>