21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1991 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  100 
 
 		 447 aa  884    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0414  hypothetical protein  32.88 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.103112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2177  hypothetical protein  31.48 
 
 		 463 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2129  hypothetical protein  31.48 
 
 		 463 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0415  hypothetical protein  32.23 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1915  hypothetical protein  35.05 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1477  hypothetical protein  32.06 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0545423  normal  0.74916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1451  Ets- domain containing protein  32.54 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26391  hypothetical protein  42.15 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0320  hypothetical protein  38.89 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.935671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2371  hypothetical protein  34.62 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4411  membrane protein-like protein  31.28 
 
 		 663 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0414403  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08120  predicted membrane protein  33.17 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0753  membrane protein-like protein  28.95 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.844921  normal  0.0837231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2573  hypothetical protein  27.87 
 
 		 489 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2911  hypothetical protein  30.37 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  0.0308568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10860  predicted membrane protein  29.38 
 
 		 525 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  28.69 
 
 		 869 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1346  Protein of unknown function DUF2079, membrane  31.4 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001004 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09720  predicted membrane protein  37.21 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.523461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0363  membrane protein-like  35.9 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115908  normal  0.868887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>