22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4300 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  73.68 
 
 		 860 aa  1062    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  43.57 
 
 		 826 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0779  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 687 aa  84.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0029  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.642435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  25.26 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  35.62 
 
 		 893 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  35.76 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  31.46 
 
 		 893 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  26.98 
 
 		 522 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  26.98 
 
 		 522 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1597  hypothetical protein  23.19 
 
 		 477 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1099  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 872 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000342795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  34.75 
 
 		 640 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  26.74 
 
 		 735 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2055  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 		 729 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.265911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1991  membrane protein-like protein  28.69 
 
 		 447 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.975247  normal  0.0103529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  37.27 
 
 		 688 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4001  hypothetical protein  33.59 
 
 		 719 aa  48.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  29.35 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  31.45 
 
 		 751 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  27.1 
 
 		 636 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>