31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3626 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1242    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  65.46 
 
 
634 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  33.48 
 
 
418 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  33.48 
 
 
418 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.43 
 
 
520 aa  94  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  29.2 
 
 
434 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  29.03 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  28.43 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  26.97 
 
 
404 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  31.03 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  26.69 
 
 
385 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  31.42 
 
 
412 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  31.37 
 
 
389 aa  61.6  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  26.99 
 
 
400 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  30.59 
 
 
388 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  32.06 
 
 
378 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  32.54 
 
 
399 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  27.67 
 
 
355 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.48 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0221  hypothetical protein  28.31 
 
 
324 aa  55.1  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.337479  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
714 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  36.8 
 
 
454 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  28.9 
 
 
394 aa  53.5  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  32.79 
 
 
354 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  21.96 
 
 
379 aa  48.9  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  31.12 
 
 
428 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.27 
 
 
419 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2145  hypothetical protein  26.94 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  27.4 
 
 
672 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  25.7 
 
 
653 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  27.1 
 
 
869 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>