18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3865 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  100 
 
 		 860 aa  1650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  73.68 
 
 		 869 aa  1150    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  42.5 
 
 		 826 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0779  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 687 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0029  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.642435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  27.58 
 
 		 528 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1597  hypothetical protein  25.18 
 
 		 477 aa  72  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  37.27 
 
 		 893 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  32.51 
 
 		 893 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  24.04 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  24.04 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  32.35 
 
 		 827 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  25.17 
 
 		 649 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4001  hypothetical protein  33.59 
 
 		 719 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  30.17 
 
 		 640 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  31.69 
 
 		 688 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2055  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 729 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.265911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 672 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>