20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1601 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1269    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  70.34 
 
 		 655 aa  813    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  26.27 
 
 		 623 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  24.12 
 
 		 642 aa  88.6  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  26.54 
 
 		 659 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  24.26 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  25.08 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  25.39 
 
 		 672 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  25 
 
 		 765 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  25.24 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  29.21 
 
 		 688 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  23.03 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  25.74 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  26.05 
 
 		 705 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  25.81 
 
 		 543 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  23.8 
 
 		 795 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  25.69 
 
 		 678 aa  50.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  26.36 
 
 		 768 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  26.02 
 
 		 860 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  25.98 
 
 		 782 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>