25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4209 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  67.45 
 
 		 705 aa  752    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1339    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  34.21 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  31.65 
 
 		 734 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 680 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  28.1 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  31.28 
 
 		 523 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  28.68 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  30.89 
 
 		 655 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  35.97 
 
 		 827 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  28.15 
 
 		 485 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  34.27 
 
 		 869 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  28.06 
 
 		 653 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1099  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 872 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000342795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  27.32 
 
 		 623 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 686 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0881  hypothetical protein  28.97 
 
 		 748 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.143496 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2449  hypothetical protein  29.85 
 
 		 394 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  28.64 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  28.11 
 
 		 475 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  28.92 
 
 		 519 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  29.46 
 
 		 768 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  29.79 
 
 		 498 aa  44.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  29.94 
 
 		 447 aa  44.3  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  35.29 
 
 		 860 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>