40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2658 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2726  tetratricopeptide TPR_4  76.56 
 
 
687 aa  993    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2658  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
686 aa  1356    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  49.3 
 
 
710 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1093  glycosyl transferase family protein  40.72 
 
 
692 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  29.56 
 
 
709 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.01 
 
 
680 aa  167  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0161  hypothetical protein  28.72 
 
 
678 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0126763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  29.42 
 
 
725 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2727  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
729 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4225  hypothetical protein  28.51 
 
 
734 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0726611  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2659  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
718 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0852  hypothetical protein  28.81 
 
 
699 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.33804  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2657  hypothetical protein  27.51 
 
 
794 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2828  hypothetical protein  25.63 
 
 
764 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.977111  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2725  hypothetical protein  24.77 
 
 
782 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3887  hypothetical protein  27.31 
 
 
756 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2397  hypothetical protein  25.72 
 
 
406 aa  63.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
452 aa  61.6  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2225  hypothetical protein  30.58 
 
 
399 aa  61.6  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.526626  hitchhiker  0.00000291502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4609  hypothetical protein  23.77 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0341  hypothetical protein  22.87 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2057  hypothetical protein  25.64 
 
 
464 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0086  hypothetical protein  26.01 
 
 
464 aa  57  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4917  hypothetical protein  21.95 
 
 
417 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4932  hypothetical protein  21.95 
 
 
417 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3452  hypothetical protein  26.74 
 
 
417 aa  54.7  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0127  hypothetical protein  26.19 
 
 
449 aa  54.7  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  32.37 
 
 
705 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0954  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.11 
 
 
408 aa  52.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00296264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3113  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
610 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.264038  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.77 
 
 
2073 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0574  hypothetical protein  25.23 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0845454  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2031  hypothetical protein  25.78 
 
 
463 aa  48.1  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1890  hypothetical protein  27.43 
 
 
416 aa  47.8  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  30.94 
 
 
688 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3908  hypothetical protein  30.87 
 
 
806 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2611  hypothetical protein  26.36 
 
 
441 aa  45.8  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0243  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
552 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286345  hitchhiker  0.000000659139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  30.34 
 
 
1143 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>