30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2505 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  100 
 
 
768 aa  1528    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  30.18 
 
 
735 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  29.53 
 
 
698 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01280  hypothetical protein  30.15 
 
 
576 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.292249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2508  hypothetical protein  26.86 
 
 
649 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0564678  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0994  hypothetical protein  25.28 
 
 
515 aa  97.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1027  hypothetical protein  25 
 
 
515 aa  91.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2744  unknown, LphB  25.32 
 
 
546 aa  81.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2617  unknown, LphB  24.89 
 
 
547 aa  80.9  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01380  hypothetical protein  26.51 
 
 
722 aa  70.5  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1411  hypothetical protein  27.84 
 
 
303 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00357704  normal  0.0994638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  27.06 
 
 
636 aa  65.1  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2115  hypothetical protein  27.04 
 
 
486 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5646  hypothetical protein  28.87 
 
 
668 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28170  hypothetical protein  26.82 
 
 
601 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  35.45 
 
 
705 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  28 
 
 
627 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  28.03 
 
 
676 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  28.03 
 
 
676 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  27.46 
 
 
676 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  32.85 
 
 
893 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4208  hypothetical protein  25.26 
 
 
680 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0208  hypothetical protein  28.34 
 
 
764 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  24.53 
 
 
649 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  29.17 
 
 
688 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  26.09 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25.4 
 
 
642 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  22.89 
 
 
653 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0165  arabinosyltransferase AftB  45 
 
 
667 aa  45.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  28.57 
 
 
734 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>