40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5070 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  952    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  49.31 
 
 		 519 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  47.65 
 
 		 535 aa  353  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  45.28 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  42.89 
 
 		 544 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  42.89 
 
 		 544 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  42.89 
 
 		 544 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  46.4 
 
 		 564 aa  316  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  41.38 
 
 		 485 aa  315  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  43.8 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  42.02 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  43.12 
 
 		 530 aa  296  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  42.52 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  42.25 
 
 		 586 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  42.72 
 
 		 561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  41.77 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  42.61 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  39.09 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  43.96 
 
 		 447 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  40.66 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  39.33 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  37.99 
 
 		 486 aa  230  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  41.47 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  39.6 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  35.2 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  43.71 
 
 		 648 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  41.29 
 
 		 629 aa  163  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  33.06 
 
 		 510 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  31.14 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  35.69 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  39.19 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  35.22 
 
 		 393 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  38.39 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  25.38 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.87 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  30.39 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.53184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  28 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  28.43 
 
 		 688 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0984  hypothetical protein  38.89 
 
 		 491 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>