36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_23290 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  100 
 
 
510 aa  998    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  46 
 
 
485 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  43.29 
 
 
486 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  43.84 
 
 
461 aa  269  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  38.02 
 
 
523 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  37.61 
 
 
496 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  35.67 
 
 
485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  35.6 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  37.05 
 
 
447 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  35.44 
 
 
475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  36.06 
 
 
499 aa  196  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  33.95 
 
 
544 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  33.95 
 
 
544 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  33.95 
 
 
544 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  33.79 
 
 
560 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  35.79 
 
 
519 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  33.64 
 
 
530 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  36.68 
 
 
456 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  35.25 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  36.07 
 
 
535 aa  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  30.79 
 
 
586 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  32.66 
 
 
552 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  34.53 
 
 
561 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  33.48 
 
 
498 aa  137  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  31.75 
 
 
470 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  32.16 
 
 
564 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  35.9 
 
 
648 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  37.7 
 
 
629 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  27.51 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  29.29 
 
 
393 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  25.85 
 
 
481 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  28.77 
 
 
705 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  24.3 
 
 
488 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  27.37 
 
 
396 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  27.37 
 
 
396 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  27.5 
 
 
688 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>