37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3921 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  65.84 
 
 
485 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  961    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  40.79 
 
 
523 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  40.88 
 
 
461 aa  285  9e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  42.82 
 
 
510 aa  282  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  38.48 
 
 
485 aa  273  6e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  36.42 
 
 
499 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  38.75 
 
 
447 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.4 
 
 
496 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  37.98 
 
 
435 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  36.62 
 
 
475 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  40.35 
 
 
470 aa  226  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  37.55 
 
 
535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  35.14 
 
 
544 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  35.14 
 
 
544 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  35.14 
 
 
544 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  35.39 
 
 
519 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  36.65 
 
 
498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  33.99 
 
 
560 aa  207  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  35.93 
 
 
490 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  35.61 
 
 
530 aa  203  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  34.26 
 
 
561 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  35.15 
 
 
564 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  36.56 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  33.85 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  30.75 
 
 
586 aa  171  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  34.93 
 
 
629 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  36.4 
 
 
648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  28.92 
 
 
465 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  32.19 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  31.87 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  31.87 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.79 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  28.28 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.48 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  32.85 
 
 
401 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  24.47 
 
 
488 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>