39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7035 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  100 
 
 		 519 aa  1036    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  64.96 
 
 		 535 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  55.97 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  55.97 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  55.97 
 
 		 544 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  56.32 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  53.36 
 
 		 560 aa  475  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  56.37 
 
 		 561 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  53.63 
 
 		 552 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  49.32 
 
 		 586 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  49.8 
 
 		 564 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  49.31 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  42.37 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  40.32 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  39.13 
 
 		 496 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  37.43 
 
 		 523 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  38.61 
 
 		 485 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  40.33 
 
 		 475 aa  263  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  41.54 
 
 		 490 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  38.24 
 
 		 447 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  36.24 
 
 		 486 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  36.59 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  34.25 
 
 		 461 aa  201  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  40.93 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  35.89 
 
 		 470 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  34.7 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  50.61 
 
 		 648 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  38.31 
 
 		 629 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  29.08 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.28 
 
 		 481 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  25.39 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  30.77 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  30.16 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  28.11 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  30.16 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  27.76 
 
 		 401 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6076  hypothetical protein  27.46 
 
 		 476 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  29.95 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.53184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>