39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6411 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 475 aa  931    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  54.24 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  53.7 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  39.52 
 
 		 485 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  43.35 
 
 		 435 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  40.21 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  43.84 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  37.34 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  42.61 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  38.22 
 
 		 544 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  38.22 
 
 		 544 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  38.22 
 
 		 544 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  36.62 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  37.06 
 
 		 560 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  40.33 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  37.55 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  39.51 
 
 		 535 aa  232  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  35.64 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  34.38 
 
 		 648 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 561 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  36.79 
 
 		 586 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  39.91 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  40.46 
 
 		 564 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  36.96 
 
 		 552 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  34.05 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  35.4 
 
 		 510 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  35.78 
 
 		 629 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  33.04 
 
 		 470 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  30.61 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  28.12 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  32.76 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  31.62 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.72 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  30.69 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  30.82 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  32.13 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0075  putative integral membrane protein  25.29 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  35.53 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  29.95 
 
 		 705 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>