14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0075 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0075  putative integral membrane protein  100 
 
 
407 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0076  putative integral membrane protein  51.48 
 
 
414 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3151  hypothetical protein  31.46 
 
 
476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.814635  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0530  hypothetical protein  32.76 
 
 
411 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0577813  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0221  hypothetical protein  31.53 
 
 
430 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.823871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6076  hypothetical protein  27.25 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  27.72 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.53184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2117  hypothetical protein  27.45 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00812439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0184  hypothetical protein  25.49 
 
 
575 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00494452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  26.59 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  26.3 
 
 
499 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  27.66 
 
 
496 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  26.6 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  36.9 
 
 
481 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>